蔡英文發表以《感謝與承擔》為題的就職演辭，全篇6000字，兩岸關係部分卻只有318字，提了4次中華民國，卻沒有提過「一中」或「兩岸同屬一中」，但她強調尊重「1992年兩岸兩會秉持相互諒解、求同存異的政治思維，進行溝通協商…，在這個既有的事實政治基礎上，持續推動兩岸關係和平穩定發展」，並提出全新的論述：「新政府會依據中華民國憲法、兩岸人民關係條例及其他相關法律，處理兩岸事務」。蔡特別定義「政治基礎」包含幾項關鍵元素：
- 1992年兩岸兩會會談的歷史事實與求同存異的共同認知，這是歷史事實；
- 中華民國現行憲政體制；
- 兩岸過去20多年來協商和交流互動的成果；
- 台灣民主原則及普遍民意。
人正在美國的宋楚瑜透過親民黨發表聲明說，蔡的論述明顯是「沒有用九二共識4個字來承認了九二共識，明智的大陸領導人，也會有正回應，未來兩岸關係也不致於大幅倒退。」
蔡英文上午在總統府宣誓就職時，一字不漏地唱起國歌，與去年雙十國慶時拒唱「吾黨所宗」不同，之後她在演辭中，也強調台灣要成為一個「和平的積極溝通者」，新政府並會依據中華民國憲法、兩岸人民關係條例及其他相關法律，處理兩岸事務。她呼籲兩岸的兩個執政黨應該要放下歷史包袱，展開良性對話，造福兩岸人民。
