齊柏林為紀錄片《看見台灣II》空拍勘景，9日乘坐凌天航空資深飛行員張志光駕駛的直升機從台中機場起飛，一行3人飛至屏東縣臨時起降場降落，10日早晨6時許至8時許在屏東縣首度起降，拍攝墾丁風光，8時許至10時許自屏東飛往台東池上，10時許從池上三度起飛，計劃飛越花東縱谷、瑞穗、秀姑巒溪出海口、長虹橋後，再南下沿著海岸線飛行，但起飛1小時後失聯。在飛至花蓮縣上空時，飛機疑因漏油冒出黑煙，起火墜毀在豐濱鄉新長虹橋附近產業道路的一家果園，機上3人全數罹難，屍體燒焦。失事現場有大片飛機殘骸，消防人員表示，2人陳屍在機艙內，1人則摔出機外。
消息傳出，全台哀慟，前總統馬英九和時任總統蔡英文等人紛紛發言。曾在《看見台灣》片尾獻唱《拍手歌》的布農族原聲童聲合唱團，晚上正好在台南演出，為紀念齊柏林，也臨時在表演結束時獻唱齊最愛的歌曲《乘著氣球上天空》，以及一首《送別》。
