身兼台北市副市長的台北農產運銷公司董事長陳景峻，宣布辭去北農董事長一職，九月正式卸任。國民黨和民進黨台北市長參選人皆認為陳景峻的辭職是市長柯文哲的政治操作。
陳景峻表示，請辭原因主要有兩個。第一個，他身兼台北副市長與擔任北農董事長角色有衝突。北農的監察機關是台北市場處，但同時市場處是由副市長監督。故此，陳景峻認為他所擔任角色會出現混淆。而當中也因此產生很多爭議，例如勞動局要處罰北農有關勞退準備金等等，他身兼副市長及北農董事長角色是存在衝突。
第二個則是，這年台北市與北農之間經常出現紛擾，陳景峻認為自己就處理所謂的公司跟市政府的問題，中間出現很多枝節，令問題不能圓融地處理。他又表示自己並不樂見北農現時被指是政治角力的場所，他說：「為了避免中央民進黨、柯文哲市長和台北市政府受傷，我認為我辭掉應該是最適當的。」
陳景峻接任董事長期間，和總經理吳音寧不和，從年初休市事件，農委會、台北市市場處、北農三方不斷互相評擊，當時陳景峻已多次公開表示對吳音寧不滿，除了批評吳音寧遇到麻煩只懂逃避，還暗指農委會對他並不公平，權力全都給予總經理，但責任則由董事長承擔。
被問到在任期間，吳音寧是否令他心力交悴，以及需要下台，陳景峻說吳音寧個人所做的事，就需她個人承擔後果，若她認為不需到市議會接受質詢，這後果也是由她個人承擔。他續指，對於吳音寧，外界自有評論。但他強調，請辭與吳音寧無關。
民進黨陳景峻曾表示，吳音寧的果菜市場改建版本是透過民進黨市議員簡舒培於質詢時提出，但吳音寧一直堅持不到台北市議會接受質詢，而九合一選舉將近，他認為難免會讓柯文哲覺得是民進黨在「搞他」。陳景峻指希望能扮演好「白綠」之間的橋樑，只是有時夾在中間左右為難，已曾向柯文哲請辭4次北農董事長一職。
就陳景峻辭去北農董事長一職，國民黨台北市長參選人丁守中表示，柯文哲大概是在累積民怨，選前會再換掉吳音寧，是選舉的策略性操作。他指吳音寧是北農總經理，當然有義務到議會接受質詢，他又說：「(吳音寧)有中央作靠山換不了，但台北市政府手上的工具太多了，柯文哲大概正在累積民怨，是策略性操作。否則怎麼會逼到副市長請辭果菜公司董事長，然後讓吳音寧去做寶座，累積民怨選情換掉吳音寧，做為選舉收割的工具。」
而民進黨台北市長參選人姚文智則指陳景峻是柯文哲政治操作下的代罪羔羊，他說：「柯文哲在表面上，是想要拉攏國民黨的地方派系，在背面，則想操作選舉鬥爭，陳景峻應該是在這樣的邏輯下被請辭，他當然有口難言」，姚文智又指，柯文哲再次表現出有功則攬、有過推下屬的風格，認為此是柯文哲一貫危機處理模式。
而競爭連任的台北市長柯文哲對以上評論則未正面回應，只說感到陳景峻真的累了，才讓他過了總質詢之後辭職。至於接任人選，柯文哲表示已拜訪過行政院農業委員會主委林聰賢，但還需與農委會討論。
