《明報》報道高鐵一地兩檢爭議，運輸及房屋局發言人表示，安全及保安統籌委員會是常設委員會，其職權範圍並不包括處理廣深港高速鐵路香港段的清關、出入境及檢疫安排。委員會負責審批鐵路車站、鐵路車廠及相關建築結構（鐵路處所）的安全及保安事宜（包括緊急情況下的逃生、救援、消防等），該批技術性文件及圖則皆為討論上述事宜而擬備。
局方又強調高鐵香港段通車時，於西九龍總站落實一地兩檢，發揮最大效益，所以已預留空間設置一地兩檢的口岸設施。並與複雜的憲制、法律及運作問題，由律政師、保安局、運輸及房屋局和政制及內地事務局共同研究。
律政司表示沒有收過該設計文件，亦沒有參與「安全及保安統籌委員會」的討論，又指由於「一國兩制」涉及複雜的法律及操作問題，相關工作仍進行。
