日本防衛省決定，增加救援自衛隊員人數，從1.5萬增至2.5萬人。再者，有約200名自衛隊人員，由清晨約5時半起展開搜索行動，搜查建築物內生還者。熊本縣內約有9萬人被迫棲息在避難處所，日本政府正著手準備供應90萬份食物，可供災區人民食用3天。
日本首相安倍晉三原定16日到災區視察，但凌晨又強震后，為了坐鎮指揮救災，臨時取消勘災行程。安倍倍晉告訴記者說：「我們正盡一切努力評估災情，因為可能擴大。」
日本氣象廳在此前的新聞發布會上表示，不能確定是否還會發生同等或更大地震，因此要求當地居民提高警惕，注重人身安全。而更令人擔心的是，九州今將迎來降雨，可能伴隨大風，不排除引發次生災害。
