總統府發言人黃重諺說明，專案小組對馬英九出境赴港申請考量理由共有4點：
- 馬前總統經管或接觸之國家機密甚鉅，且因甫卸任不足一月，相關機密仍具高度保密之必要。
- 馬前總統任內所經管或接觸之國家機密檔案及資料，尚待更多時間清查確認。
- 香港對我國家安全之維護係屬高度敏感地區，卸任總統於出境管制期間造訪香港之風險難以管控。
- 國安局與香港政府相關合作並無前例可循，復以本案時間緊迫，難以與中國大陸及香港政府充分協商。
黃重申，專案小組建議不同意馬之申請，是評估此行程所能達成之目的與中華民國國家安全利益可能造成之風險之間兩相權衡，尚難認為符合比例原則，專案小組建議馬可以國際視訊會議等作法，達成發表演說的目的。