2005年12月底，國安局將程翔案件移交北京市第二人民檢察院，目前檢察院正研究是否提出公訴。無綫電視引述內地消息透露，程翔被扣押在距離北京市中心不足一小時車程的一所看守所內。當地居民指出，這看守所過去一直用來扣留境外涉嫌犯罪者。
報道又指，程翔的兄弟及妹妹過去幾個月曾兩次到北京探望他，其中一次是2005年9月至10月期間，彼此會面近半小時。其家人更透露，程翔消瘦不少。
據悉，程翔在被扣留的8個多月以來，一直未有與律師接觸，是由於當時國安局尚有資料未弄清楚，因此2005年年底程翔被移送到檢察機關前，未有獲准見律師。不過，自案件移交檢察院後，程翔已可以自行或委託家人聘請律師，由內地檢察機關審查有關律師的資格，如獲批准，程翔可以與律師見面。