法國各地接連發生懷疑針對穆斯林的襲擊，在巴黎以西的勒芒，有清真寺凌晨遭投擲3枚手榴彈，玻璃窗上留有彈孔；南部城市納博訥附近有人在祈禱時間完結後，向穆斯林禮拜堂開槍，無人受傷；東部城市索恩河畔自由城一間清真寺附近的土耳其烤肉店亦發生爆炸，無人傷亡。索恩河畔自由城的市長貝爾納·佩呂接受媒體採訪時說，他認為該市餐館爆炸很可能與7日的雜誌社恐怖襲擊案有關。
法國擁有全歐洲最大的穆斯林人口，有巴黎居民擔憂《查理周刊》恐襲案只會令外界對伊斯蘭教的印象變得更差，進一步撕裂社群之間的關係，對穆斯林和法國是雙輸局面。