林榮基返港後跟呂波、李波及張志平一樣，馬上到警署就其失蹤案件銷案，他並指，毋須特區政府協助。林在記者會上說，「我不知道港府救過誰，對梁振英無話可說明」。特首梁振英今年1月4日針對事件首次開腔指，內地執法人員不能在港執法，之後一天再說高度重視事件，希望當時已經失蹤的李波提供資料。
時事評論員劉銳紹說，與2005年資深傳媒人程翔在內地被拘禁事件比較，特區政府的反應明顯不同，是年4月22日程翔在羅湖過關返回內地時被拘禁,翌年被指涉及間諜罪判監5年，當年的特首曾蔭權及部分局長級官員曾協助程翔家人3次將信件轉交中央政府，爭取程翔獲釋。他說：「反觀銅鑼灣書店事件，都沒有聽到特區政府做過甚麼。」
