教育局就學校擬停辦國慶升旗禮回應，表示此舉會發出錯誤訊息，將少數人對國家觀念、國民身分的誤解合理化，無益於培養學生尊重國家和互相尊重的精神，因而期望校方今年可以如常升旗和奏唱國歌，包括在國慶日前後舉辦升旗禮。
教育局發言人表示學校有責任教育學生認識及尊重國歌和國旗，培養他們的國民意識和觀念，形容這是四海皆然之事。發言人強調，「不把社會上的政治矛盾帶進校園」絕不能與「培養學生的國民意識」混為一談，在教育層面上不論香港內部有何政治議題，均無理由影響培養學生的國民意識的工作。
發言人指，學校素來在重要日子及特別場合舉行升旗禮，對國家以示尊重，並提高師生的國民意識。如有個別學生對升旗有意見或有不當行為，反映他不理解尊重國歌和國旗背後的意義，校方應藉此機會向他解釋並疏導其情緒，而不是對學生的誤解聽之任之。
發言人重申，如有個別學校擬停辦國慶升旗禮，即使校方事前沒有上報教育局，當局也會了解有關情況。如有需要，當局會提供專業意見和支援，讓事情做得更好。
教育局局長楊潤雄上周六（21日）會見傳媒時也回應過有關問題，他表示在校內升旗或奏唱國歌是讓師生表達對國家感情的機會，也是教育學生學懂如何尊重國旗和國歌的機會。他認為身為中國人，國慶是每一個香港人的國慶，所以每一個香港人都應該參與一些國慶活動。
早前有傳媒引述消息指，葵青區內至少三所中學因反修例行動而擬停辦國慶升旗禮。有校長表示憂慮校外「護旗手」與校友發生衝突，希望當局須考慮學校安全。
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