柯文哲最近被指曾向妻子自曝到過內地買春及涉及內地器官買賣，民進黨台北市參選人姚文智較早前指台北市長柯文哲曾18次到訪內地，質疑其目的。柯文哲回應指到內地大部分時間都是教當地的醫生如何使用「人工肺」。
姚文智較早前表示柯文哲曾到內地18次，質疑其去得如此頻繁的原因。他指如果不是為做生意，去內地18次如此頻繁，或會引起各種猜測，但很少看到柯文哲就此直接回應，認為柯應該給一個直接的說法。
柯文哲對此回應表示到內地大部分都是教如何使用「人工肺」，內地會使用「人工肺」的醫生差不多都是他教的，當時除了東北和新疆的醫院，其他的都去過。
台灣資深傳媒人楊憲宏最近指柯文哲曾於前副總統呂秀蓮宴會中，在妻子面前自曝曾到內地受「花名冊」招待，被質疑到內地買春。柯文哲又被台灣出板社蝴蝶蘭文創負責人吳祥輝，於報紙刊登廣告指控其涉及內地器官買賣。柯文哲均指為政治抹黑。
