台灣海巡署和農委會派2艘中型艦艇「巡護九號」和「漁訓貳號」到沖之鳥附近海域護漁。海巡署表示，若日本有不友善動作，台灣艦艇會有相應行動。 艦艇從高雄港出發前往沖之鳥礁，護漁3個月，預料2至3天抵達。「巡護九號」排水量1900噸，配備20機砲，4支強力水砲和M16步槍，有40名官兵，「漁訓貳號」則沒有武裝，軍方還派出拉法葉艦在適當距離策護，如有狀況可最短時間內馳援。
海巡署副總局長姚洲典表示：「我們海巡署的基調是不迴避、不衝突和不挑釁。我們不會主動來展示這種不友善的行為。」若遇到緊急情況，海巡署將會派出300噸級「高雄艦」前往支援，除了20機炮外，還配備快炮、機槍，並可供直升機升降。但有網民質疑，官方不從航程近的台北部港口出發，卻從高雄出海，有作騷意味。
