法國當局仍然繼續調查「德國之翼」黑盒，以找出墜毀的原因。據一位參與調查的軍官向《紐約時報》披露，在航程初期，機師間的對話正常。之後一名機師離開駕駛艙，折返之際卻被鎖在門外，機師多次敲門及強闖也不成功。法國馬賽檢察官羅賓，在分析過黑盒公布指，正機師離開駕駛艙後，被副機師反鎖，然後故意人手控制客機急降撞山。
「德國之翼」的母公司，漢莎航空行政總裁表示「無言以對」，因為該名副機師已通過所有飛行及醫療測試，證明適合執行駕駛任務。法國當局相信事件並非恐怖襲擊，不過拒透露副機師宗教背景。
根據德國《圖片報》及《華爾街日報》，正機師名為「Patrick S」，有兩名子女；而副機師盧比茨28歲，在2013年9月完成訓練後加入「德國之翼」，累積有630小時飛行經驗。
