前世界衛生組織總幹事李鍾郁去世後，中國國家外交部發言人劉建超，在7月26日表示，中國政府決定推薦陳馮富珍競選世衞總幹事一職，讚揚她世衞工作後成績卓著，認為她對世衞的未來發展有系統而成熟的考慮。根據世衞規定，陳馮富珍需離開現時助理總幹事的職位，她透露將會投入競選工作，更會到北京與中國討論競選事宜。
34個國家的世衞組織執委選出新任總幹事，執委會11月6至8日開會，並與候選人作最後面試，將於在11月9日公布新任總幹事的人選。陳太的主要對手為56歲，被日本政府提名的時任世衞西太平地區總監尾身茂，以及53歲的墨西哥衞生部長弗倫克（Juilo Frenk）。總幹事年薪金約110萬至120萬港元。